利用甲烷细菌
共生体的识别,由于没有被培养,依靠与独立生存的有氧氧化菌。Methanotrophic细菌、独特的能力使用甲烷作为衬底,形成methylotrophs的子集,利用C1收购能源和碳化合物(安东尼1982)。共生菌最密切相关的独立生存的I型γ变形菌门有氧氧化菌,根据膜组织,C1同化途径和系统发育关系(汉森et al . 1991;Bratina et al . 1992;鲍曼et al . 1993年)。尽管I型和II型菌表现出广泛的内部膜系统,在I型,discshaped囊泡的内部膜排列成束分布在整个细胞(图2 b, c),但双膜限于在II型菌细胞的外围。因为厌氧氧化菌,负责全球甲烷氧化(Reeburgh 1980;Hinrichs et al . 1999;Boetius et al . 2000年),和泥炭bog-inhabiting嗜酸菌的α-变形菌门(Dedysh 2002)远亲methanotrophic共生体,我们的讨论集中在I型菌。
的细节methanotrophic共生有机体代谢主要是根据我们的知识推断独立生存的I型和II有氧氧化菌。通过甲烷的氧化、电子传递和氧化磷酸化产生ATP和有机C3化合物与甲醛合成(图3;汉森和汉森1996)。甲烷单氧酶(网络游戏),微粒(pMMO)绑定到胞浆内的膜或可溶性(sMMO)根据物种,发起的甲烷氧化通过引入氧甲烷,从而形成水和CH3OH。甲醇氧化为甲醛(一氧化碳)由周质的甲醇脱氢酶(MeDH)。甲醛氧化为甲酸通过多种酶系统,根据氧化菌的类型。最后,甲酸氧化为二氧化碳的NAD-dependent甲酸脱氢酶。虽然整个甲烷氧化途径是相同的两种类型的菌,在I型和II型菌,C1-utilization发生通过一磷酸核酮糖(残余)途径和丝氨酸途径,分别(图3)。
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