Methanotrophic细菌

的属性methanotrophic细菌广泛审查了汉森和汉森(1996)。本节总结了最相关的方面理解功能methanotrophic生态垃圾填埋场覆盖土(参见第十章)。

氧化菌是革兰氏阴性细菌能够利用CH4为唯一碳和能量来源。他们methylotrophs的一个子集,可以使用一个碳化合物比HCOOH减少碳源和能源。区分从其他methylotrophs菌使用甲烷单氧酶(MMO)酶,它催化甲烷的氧化甲醇。

当前分类的methano-trophs首次建立了Whittenbury et al。(1970),基于形态学和生物化学特征。更全面的研究包括数值分类法和dna dna杂交需要一些修改(鲍曼et al ., 1993, 1994, 1995)。两种类型的methano-trophs,贴上I型和II型,是杰出的。鲍曼和他的同事一直引用这些类型的组我和“第二组”。截至1995年,I型包括属甲基球菌属、Methylomicrobium, Methylobacter Methylomonas,形成家庭Methylococcaceae。II型包括属Methylosinus Methylocystis。

I型菌形成一个独特的分支在γ变形菌门的细分。他们用微粒MMO (pMMO)氧化甲烷。甲醛、CH4氧化产品,使用一磷酸核酮糖同化途径(臀部)。大多数I型菌不能修复N2(缺乏固氮酶活动)。例外情况是一些Methylomonas和甲基球菌属的物种。

II型菌形成一个独特的分支在α-变形菌门的细分。他们使用pMMO,但在缺乏铜溶酶(sMMO)是产生在大多数II型metha-notrophs和I型菌。这种酶具有广泛的底物特异性和使这些微生物的氧化氯化烃和芳烃。II型菌通过丝氨酸途径吸收甲醛。他们也能够解决N2。

残渣途径比丝氨酸更高效的途径。因此,类型

我菌往往超过他们的类型

二世,除非无机氮或铜限制为II型提供了一个优势物种,表达sMMO或nitro-genase活动。

在这个分类,甲基球菌属I型属中占据着特殊的位置。从该属物种温和高温,表达sMMO和nitroge-nase活动,有时使用丝氨酸通路。由于这些原因这属曾称为类型x这个术语变得无关紧要的发现其他属不同寻常的特性,已不再使用了。

小说methanotrophic物种,属不断被发现。我属包括新型psychro-philic Methylosphaera(鲍曼et al ., 1997),在高温Methylocaldum (Bodrossy et al ., 1997)和Methylothermus (Tsubota et al ., 2005),强烈集群Methylosarcina(明智的et al ., 2001)和嗜盐的Methylohalobius(嘿et al ., 2005)。一个新的II型属轻度嗜酸性Methylocella (Dedysh et al ., 2000年,2004年;Dunfield et al ., 2003)。甚至Dedysh et al。(2002)提出了一个新属Methylocapsa第三类型的分类,由温和嗜酸菌不是表达sMMO,而是使用丝氨酸通路。这个属属于Methylocella a-Proteobacteria和最亲密的关系。

明智的et al。(1999)发现methanotrophic隔离的结果硝酸浓缩系列的强度取决于矿物介质使用,结果表明充实并不一定代表原位生态。

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