分类学多样性

在真核生物物种多样性,包括真菌、栖居于冻土视野,收集在北极,一直强烈的主题研究在过去的十年里(Dmitriev et al . 1997;Kochkina et al . 2001;Vishnivetskaya et al . 2003年)。然而,真菌检测的完整列表没有被报道。公布结果总结在表7.1中,列有菌丝的真菌中发现冻土北半球的视野。使这幅画完成,我们也表示报告在北极苔原土壤,一样可以找到真菌物种的深陷的视野北极的栖息地。表7.1显示,北极永久冻土的真菌表现出相当大的分类学多样性。真菌物种的出现频率的分析表明,Geomyces pannorum,枝孢属spp,曲霉菌种虫害是最常见的。属青霉菌代表是最大数量的物种。有趣的是,物种最常发生在深视野也从现代分离北极土壤长期研究过程中。

表7.1在北极permafrosta真菌生物多样性

物种

引用

枝顶孢属pteridii w .联欢等

Ozerskaya et al。(2008)

弗兰克兰

答:salmoneum W。gam et Lodha

Ozerskaya et al。(2008)

主产(薯条)摘要

Kirtsidely (1999 a), Ivanushkina et al。(2005),

库雷克et al。(2007)

Arthrinium sphaerospermum Fuckel

Ivanushkina et al。(2005)

来自烟曲霉菌Fresen。

Ivanushkina et al。(2005)

答:尼日尔van Tiegh。

Etienne Kirtsidely (1999), (2002),

Ivanushkina et al。(2005、2007)

答:oryzae (Ahlb)。E.Cohn

Ivanushkina et al。(2005)

答:sclerotiorum G.A. Huber

Stakhov et al。(2008)

答:sydowii (Bainier et Sattory)

Ivanushkina et al。(2005、2007)

托姆教堂等

答:多色的(Vuill)。Tirab。

Zabawski (1982), Ivanushkina et al。(2005年,

2007),库雷克et al . (2007)

Aureobasidium支链淀粉(对于)

Ivanushkina et al。(2005), Kirtsidely (1999)

g . Arnaud var.支链淀粉

答:支链淀粉(对于)g . Arnaud var。

Ozerskaya et al。(2008)

melanogenum Herm.-Nijh。

Bispora触角亚门(per)。已经梅森

Ivanushkina et al。(2005)

葡萄孢菌。

Ivanushkina et al。(2005),库雷克et al。(2007)

毛壳菌属globosum Kunze

Zabawski (1982), Ivanushkina et al。(2005)

C。indicum变化

Ivanushkina et al。(2005)

Chaetophoma sp。

Ivanushkina et al。(2005)

Chrysosporium merdarium (Ehrenb)。

Ozerskaya et al。(2008)

J.W. Carmich

枝孢属cladosporioides(耐火的)。

库克和Fournelle (1960), Zabawski (1982),

G.A.德弗里斯

Kirtsidely (1999 a), Ivanushkina et al。(2005),

库雷克et al。(2007)

(继续)

88年

美国Ozerskaya et al。

表7.1(继续)

物种

引用

c . herbarum (per)。链接

Zabawski (1982), Ivanushkina et al。(2005),

库雷克et al。(2007)

c . macrocarpum就

Ivanushkina et al。(2005)

c . sphaerospermum Penz。

Ivanushkina et al。(2005), Stakhov et al。(2008)

Engyodontium专辑(污水)这位

Ivanushkina et al。(2005)

Eurotium amstelodami l·曼京

Ozerskaya et al。(2008)

大肠herbariorum (F.H. Wigg)。链接

Ozerskaya et al。(2008)

大肠石w·布雷默

Ivanushkina et al。(2005)

Exophiala jeanselmei (Langeron)

Ivanushkina et al。(2007) (Langeron)麦金尼斯

var. heteromorpha (Nannf)。这位

等嗜Padhge

尖孢镰刀菌Schltdl。

库克和Fournelle (1960), Kirtsidely (1999),

Ivanushkina et al。(2005)

F以上(集市)。Sacc。

Ozerskaya et al。(2008)

地丝菌属candidum链接

Ivanushkina et al。(2005)

Geomyces pannorum Sigler et(链接)

Etienne Kirtsidely (1999), (2002),

J.W.卡迈克尔

Ivanushkina et al。(2005),库雷克等。

(2007),Stakhov et al。(2008)

G。vinaceus Dal Vesco

Ozerskaya et al。(2008)

Gliocladium sp。

Ozerskaya et al。(2008)

Lecythophora mutabilis (J.F.H. Beyma)

Ozerskaya et al。(2008)

W。gam et麦金尼斯

Malbranchea pulchella Sacc。et Penz。

Ozerskaya et al。(2008)

Monodictys glauca(库克et Harkn。)

Ivanushkina et al。(2005)

美国休斯

毛霉菌plumbeus Bonord。

Ivanushkina et al。(2005)

拟青霉属variotii Bainier

Ivanushkina et al。(2005)

青霉菌aurantiogriseum Dierckx

Zabawski (1982), Kirtsidely (1999 a, b),

Ivanushkina et al .(2005、2007),库雷克等。

(2007),Stakhov et al。(2008)

P brevicompactum Dierckx

Zabawski (1982), Kirtsidely (1999),

艾蒂安(2002),Ivanushkina et al。(2005)

p . chrysogenum托姆

Zabawski (1982), Kirtsidely (1999),

Ivanushkina et al . (2005、2007),

库雷克et al。(2007)

p . citrinum托姆

Ivanushkina et al。(2005)

p . crustosum托姆

Ivanushkina et al。(2005)

p . decumbens托姆

Ivanushkina et al。(2005)

p . glabrum韦斯特林(因)

Zabawski (1982), Kirtsidely (1999 a, b, 2001),

Ivanushkina et al。(2005)

p . granulatum Bainier

Zabawski (1982), Kirtsidely (2001),

Ozerskaya et al。(2008), Stakhov et al。(2008)

p . griseofulvum Dierckx

Ozerskaya et al。(2008)

p . melinii托姆

Ivanushkina et al。(2007)

p . miczynskii K.M. Zalessky

Kirtsidely (1999 a, b), Ivanushkina et al。(2007)

p . minioluteum Dierckx

Ivanushkina et al。(2005、2007)

p . puberulum Bainier

Ivanushkina et al。(2005)

p . purpurogenum斯托尔

Kirtsidely (1999 a), Ivanushkina et al。(2005)

(继续)

(继续)

表7.1(继续)

物种

引用

P . restrictum J.C.吉尔曼等业务雅培P rugulosum托姆P simplicissimum (Oudem)。托姆

P variabile Sopp P verrucosum Dierckx P viridicatum韦斯特林Papulaspora sp。

Phialophora fastigiata (Lagerb。et Melin)

柯南特P melinii (Nannf)。科南特Phoma crystallifera Gruyter Noordel。

et Boerema博士破坏性Plowr。博士jolyana Piroz。et Morgan-Jones var。

jolyana博士herbarum即。博士nebulosa (per)。傻瓜。Rhinocladiella atrovirens Nannf。Scopulariopsis假丝酵母(Gueg)。Vuill。葡萄穗霉属chartarum (Ehrenb)。S.Hughes

Sphaeronaemella mougeotii (Fr) Sacc。孢子丝菌属pruinosum J.C.吉尔曼等业务雅培Thysanophora penicillioides (Roum)。

b Kendr。木霉属longibrachiatum Rifai Ulocladium atrum就美国葡萄孢属就Valsa sordida·尼奇克黄萎病sp。

Xylohypha nigrescens (per)。已经梅森

菌丝无菌(白色;黑暗的;黑菌)

Ivanushkina et al . (2005) Ivanushkina et al。(2005) Zabawski (1982), Kirtsidely (1999),

Ozerskaya et al . (2008) Ivanushkina et al。(2005) Ivanushkina et al . (2005、2007) Ivanushkina et al . (2007) Ivanushkina et al。(2005) Zabawski(1982),库雷克et al . (2007),

Stakhov et al . (2008) Ozerskaya et al。(2008) Stakhov et al。(2008)

Ozerskaya et al . (2008) Ozerskaya et al。(2008)

Stakhov et al。(2008)

Ozerskaya et al。(2008), Stakhov et al . (2008) Ivanushkina et al。(2005) Ivanushkina et al . (2007) Ivanushkina et al。(2005)

Ivanushkina et al . (2007) Ivanushkina et al。(2005)

Ozerskaya et al。(2008)

Ivanushkina et al . (2005) Ozerskaya et al。(2008) Ivanushkina et al . (2005) Ozerskaya et al。(2008) Ivanushkina et al . (2005) Ozerskaya et al。(2008)

Zabawski (1982), Kirtsidely (1999 a, b);

库雷克et al。(2007), Ozerskaya et al。(2008), Stakhov et al。(2008)

aFungi从北极的肤浅的视野景观的不同位置进行了研究在以下文章:库克和Fournelle (1960), Zabawski (1982), Kirtsidely (1999 a), Kirtsidely (1999 b),艾蒂安(2002),Kirtsidely(2001),库雷克et al . (2007)

我们试图比较参数描述从北极永久冻土菌丝体的真菌的多样性,这是由(1)接种固体营养媒体的传统技术与水悬浮液的标本,和(2)的方法分析DNA分离直接从相同的标本(DNA鉴定进行核酸序列的使用数据库基因库;Lydolph et al . 2005年)。在比较这两种方法中,我们使用样品(包括冻土全新世和晚更新世沉积物)收集在北极东部。只有在家庭(或更高的分类群)可能比较真菌分类学多样性参数,因为直接DNA的方法隔离不支持精确的物种赋值(表7.2)。

结果比较分析成为可能的一致性评估物种组成之间的菌丝的真菌的分离复合物;为此,我们使用了索伦森相似性指数,的值在40%的水平。较高的类群隔离电镀的数量略低,

表7.2两种真菌生物多样性研究方法(DNA文化无关的方法;板文化相关的方法)

子类

订单

家庭

方法

子囊菌

Dothideomyc -

座囊菌目

Dothioraceae

DNA

etidae

Incertae基准

- - - - - -

Incertae基准

Pseudoperis -

DNA

- - - - - -

poriaceae

Mycosphaer

Mycosphaer -

DNA

ellales

ellaceae

Pleosporales

Incertae基准

- - - - - -

Leptosphaeriaceae

DNA

- - - - - -

Pleosporaceae

DNA

Sporormiaceae

DNA

- - - - - -

Erysiphomyc -

白粉菌目

白粉菌科

DNA

- - - - - -

etidae

散囊菌目

发菌科

DNA

Incertae基准

Incertae基准

Incertae基准

DNA

Myxotrichaceae

- - - - - -

Pseudeurotiaceae

- - - - - -

Leotiomyc -

柔膜菌目

Dermateaceae

- - - - - -

etidae

Helotiaceae

DNA

- - - - - -

菌科

DNA

- - - - - -

核盘菌科

DNA

Rhytismatales

斑痣盘菌科

DNA

- - - - - -

Sordariomyc -

肉座菌目

肉座菌科

- - - - - -

etidae

Incertae基准

- - - - - -

Nectriaceae

- - - - - -

Sordariales

毛壳菌科

DNA

- - - - - -

粪壳菌科

DNA

- - - - - -

担子菌

Agaricomyc -

Polyporales

伏革菌科

DNA

- - - - - -

etidae

Cyphellaceae

DNA

- - - - - -

Fomitopsidaceae

DNA

- - - - - -

Phanerochaetaceae

DNA

- - - - - -

腔孢纲

Incertae基准

Incertae基准

Incertae基准

- - - - - -

Saccharomyc -

Saccharomyc -

酵母目Incertae基准

DNA

会好的

etidae

Urediniomycetes

Incertae基准

锈菌目

栅锈菌科

DNA

- - - - - -

接合菌纲

Incertae基准

Basidiobolales

Basidiobolaceae

DNA

- - - - - -

Mortierellales

Mortierellaceae

DNA

毛霉菌目

毛霉菌科

- - - - - -

可能是由于不育菌丝体的识别问题。其分子生物学鉴定技术很可能表明,真菌在冻土更丰富的比被认为是如此。

继续阅读:分类研究

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