验证的结果
因为我们不能排除样品得到受污染的实验装置的基础上,评估使用经验的真实性是很重要的测试。一个独立的证据的真实性古DNA的结果是应用程序的相对速度分析。就是这样一个方法——进化速率测试实证测试,并利用现代序列之间的时间差异相关,非常古老的DNA。方法推断古之间的分歧的时间序列和现代序列,通过假设分子时钟和应用发布特定基因替换率。这种方法可以失败如果发表的类群的进化是不正确的问题或问题的序列。此外,非常古老的差异也可能获得如果古代序列是从一个前所未知的现代污染物(Hebsgaard et al . 2005年)。
更加坚实的测试方法是相对利率。从本质上讲,它检查如果外集团之间的相对距离和古老的序列是明显不同于相同的外围集团和现代之间的距离序列密切相关,古老的序列(图4.2)。更有力的方法是相对速度分析。该方法估计的似然函数替换/网站,使用数据库序列最密切相关的
图4.2相对利率序列测试使用外集团,C,这是众所周知的,分支之前序列A或B O是A和B .高雅的共同祖先序列之间的相对替代率是阿和,和水之间的相对替代率是O和B . O和之间的遗传距离是否显著不同O和B之间的距离可以评估通过比较高雅和水,这都是计算使用方程封闭的盒子里
图4.2相对利率序列测试使用外集团,C,这是众所周知的,分支之前序列A或B O是A和B .高雅的共同祖先序列之间的相对替代率是阿和,和水之间的相对替代率是O和B . O和之间的遗传距离是否显著不同O和B之间的距离可以评估通过比较高雅和水,使用方程计算封闭的盒子序列。然后翻译使用出版替换率估计年龄使用分子钟(Willerslev et al . 2007年)。
进化速率测试相比,相对速度检测是独立于一个精确的校准日期和替代率。但上述分子约会和相对速度测试假设替换以一种“似钟的方式积累。更重要的是DNA进化的速度;如前所述,这些利率是不同的对于不同的人,但他们也对不同的基因。这意味着发展缓慢的速度可以非常不同的基因和飞速发展的基因。例如,对于14发表昆虫COI基因进化率可达0.3倍之间的不同和出版9 x每年可替换(Morgan-Richards et al . 2001年)。
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