生态系统水平区域指标
以区域为基础的指标可视为生态系统一级的以丰度为基础的措施，与物种一级的人口措施相对应。它们通常表示特定生态系统在特定时间的面积(km2)。面积可以表示为一些参考状态的分数，如假定的原始(潜在)面积。一个著名的例子是全球森林资源评估(粮农组织2001年)。其他是对珊瑚礁(Wilkinson 2000年)和红树林(粮农组织2003年)的评估。所有层面的生物多样性都需要一个生存区域。当一个特定物种的一半栖息地消失时，该物种的丰度大约减半。这使得面积成为一个易于理解和测量的指标。
碎片化指标在理论上是基于岛屿生物地理学的概念，该概念预测，当碎片从更大的质量中分离出来时，它们将失去物种。它们有简单的(例如，平均碎片大小，周长到有界面积比)，也有复杂的(基于分形的指数)。道路网络密度被用作碎片化的代表。
基于区域的指标建立在容易观察到的结构特征上，例如树木或珊瑚礁的覆盖，因此通常属于生态系统分类的最高级别，即生物群系。原则上，这些定义是直截了当的，没有争议，但在实践中，很难保证定义的统一应用。因此，不同信息来源之间的变化(例如，将粮农组织2001年与Achard等人2002年进行比较)通常比时间趋势高得多，至少在短期内是这样。然而，相对的时间趋势通常是一致的方向，如果不是大小。在全球层面上，只有少数几个生物群落范围趋势的时间序列存在(Jenkins et al. 2003)。
目前还不清楚海洋生态系统的等效边界是什么，因为它们的边缘在时间上可能会有更多的变化。大型海洋生态系统(Sherman et al. 1990)具有固定的空间定义，因此本身不能作为指标(尽管其中退化的部分是有用的)。海洋生物地球化学省份(Longhurst 1998)主要是利用海洋表面温度和叶绿素含量的遥感绘制的，并且在几周内高度动态，因此变化太大，短期内没有用处。因此，海洋生态系统可能更适合物种或群落(例如，海草、珊瑚礁)一级的指标。
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